Էմիլ Բաբայանը 2006-ից ՄԻԵԴ-ում ներկայացրել է Հայաստանի շահերը:
Էմիլ Բաբայանը 2006-ից ՄԻԵԴ-ում ներկայացրել է Հայաստանի շահերը: Որպես ԼՂՀ նախագահի խորհրդական ՝ Եվրոպական դատարանի հետ աշխատանքներում դե ֆակտո ներկայացրել է Լեռնային Ղարաբաղը, իսկ 2015-ին՝ որպես Արցախի նախագահի խորհրդական, ԵԽ նախարարների կոմիտեի պաշտոնական նիստին ներկայացրել է Ստեփանակերտի դիրքորոշումը: Եղել է Բարձրաստիճան պաշտոնատար անձանց էթիկայի հանձնաժողովի նախագահ:
